Situado na costa de Nayarit, na Bahia de Banderas, o arquipélago é formado por duas pequenas ilhas e duas ilhotas de origem vulcânica.
A ação do vento, do sol, das chuvas e das ondas transformou o substrato, criando diferentes ambientes que dão origem, por sua vez, a uma rica biodiversidade. Nas Ilhas Marietas é possível encontrar uma grande variedade de aves marinhas residentes e migratórias, entre as quais se destacam os gannets, vulgarmente designados por boobies, gaivotas e pelicanos.
No fundo do mar também é descoberta uma grande variedade de espécies, como moluscos, equinodermos, crustáceos, cnidiários e elasmobrânquios, o que o torna um local muito interessante para mergulho desportivo e snorkeling. O arquipélago foi recentemente declarado Reserva Especial da Biosfera.